Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLEC4AQ9UMR7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLEC4AQ9UMR7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms