Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms