Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJD2Q9UKL4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD2Q9UKL4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms