Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBE1Q9UJT0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms