Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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RABGEF1Q9UJ41 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RABGEF1Q9UJ41 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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RABGEF1Q9UJ41 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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