Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MLH3Q9UHC1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MLH3Q9UHC1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms