Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4Q9UBX2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms