Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
REREQ9P2R6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
REREQ9P2R6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms