Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP28Q9P2N2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms