Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHPF2Q9P2E5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms