Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC10Q9NYD6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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