Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINM1Q9NU53 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms