Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHDC1Q9NTX5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHDC1Q9NTX5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms