Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCC13Q9NSE7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCC13Q9NSE7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms