Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TULP4Q9NRJ4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms