Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LHX9Q9NQ69 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms