Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRHQ9HD43 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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