Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC8

GDPD2, Glycerophosphoinositol inositolphosphodiesterase GDPD2, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD2Q9HCC8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD2Q9HCC8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD2Q9HCC8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms