Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C11orf49Q9H6J7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms