Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SENP3Q9H4L4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms