Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDEM3Q9BZQ6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDEM3Q9BZQ6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms