Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABARAPL3Q9BY60 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms