Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms