Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms