Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms