Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HINFPQ9BQA5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HINFPQ9BQA5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HINFPQ9BQA5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HINFPQ9BQA5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HINFPQ9BQA5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms