Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP3Q96P20 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms