Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP47Q96K76 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP47Q96K76 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms