Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms