Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RPUSD4Q96CM3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD4Q96CM3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD4Q96CM3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD4Q96CM3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD4Q96CM3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD4Q96CM3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD4Q96CM3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms