Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM3DQ96BQ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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