Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms