Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM52Q96A61 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM52Q96A61 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms