Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMARCE1Q969G3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms