Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms