Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATRIPQ8WXE1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms