Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms