Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACBD4Q8NC06 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms