Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PNLDC1Q8NA58 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms