Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms