Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GCSAMQ8N6F7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCSAMQ8N6F7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms