Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCL2Q8N4E4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms