Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms