Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MICAL3Q7RTP6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MICAL3Q7RTP6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms