Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM43BQ6ZT52 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms