Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms