Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf47Q6ZRZ4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms