Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINGO4Q6UY18 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms