Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms