Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCSD1Q6JBY9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCSD1Q6JBY9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms